再生資源經(jīng)濟是一種新的社會經(jīng)濟運行機制，需要重新構建一個新的制度框架，對人與自然的關系和人類社會生產(chǎn)關系進行新的制度安排。制度的經(jīng)濟功能和社會功能意味著創(chuàng)新再生資源經(jīng)濟制度的必要性，制度變遷與經(jīng)濟發(fā)展和社會進步的關系說明再生資源經(jīng)濟制度創(chuàng)新的必然性，制度起源與制度本質(zhì)的理論界說有助于揭示再生資源經(jīng)濟作為一種經(jīng)濟形態(tài)制度變遷的規(guī)律性。再生資源經(jīng)濟與一般經(jīng)濟形態(tài)的不同在于它的正外部性和公共品性質(zhì)，因此，循環(huán)經(jīng)濟制度變遷的主體和動機具有特殊性，制度變遷的動力和制度供求關系的變化不是簡單地運用“經(jīng)濟人”假設、理性決策和均衡等概念可以解釋的，由此形成的制度變遷方式和路徑也需要重新設計。

運用制度變遷理論研究再生資源經(jīng)濟，包括從制度變遷與經(jīng)濟發(fā)展的關系、制度變遷與生態(tài)系統(tǒng)轉型的關系、制度創(chuàng)新與再生資源經(jīng)濟促進的關系以及促進再生資源經(jīng)濟的非正式制度等方面對再生資源經(jīng)濟制度變遷規(guī)律進行探討。在制度變遷方式上，注意強制性變遷與誘致性變遷、主導性變遷與協(xié)同性變遷、整體性變遷與局部性變遷的結合。在制度供給與需求上，根據(jù)不同領域、不同環(huán)節(jié)有著不同的制度需求，從而采取相應的制度安排：針對“既循環(huán)又經(jīng)濟”，以利用市場為主；針對“雖循環(huán)不經(jīng)濟”，以完善價格機制和產(chǎn)業(yè)化政策為主；針對“雖經(jīng)濟難循環(huán)”，以技術扶持政策為主；針對“雖經(jīng)濟不循環(huán)”，以庇古稅為主。在制度變遷路徑上，分析再生資源經(jīng)濟發(fā)展的制度互補性、制度適應性、路徑依賴性、制度關聯(lián)性與“多米諾骨牌”策略。